Nuevo test genómico diagnostica casi cualquier infección
Desde la Universidad de California en San Francisco (UCSF), Estados Unidos (EE. UU:); un equipo científico desarrolló un test genómico capaz de detectar rápidamente casi cualquier tipo de patógeno. La técnica permite encontrar en una sola prueba todo el espectro de patógenos, como bacterias, hongos, virus y parásitos. La secuenciación metagenómica de nueva generación podría acelerar la identificación de futuras pandemias víricas. Además, demostró eficacia en la identificación temprana de infecciones neurológicas, resultados que fueron publicados en Nature Medicine.
El grupo utilizó secuenciación metagenómica de nueva generación (mNGS, por sus siglas en inglés). “Su ventaja es que, en vez de buscar un tipo de patógeno cada vez, analiza todos los ácidos nucleicos, ARN y ADN, presentes en una muestra”, indicó el autor principal del estudio, Charles Chiu, catedrático de Medicina de Laboratorio y Enfermedades Infecciosas de la UCSF.
En el artículo, el equipo demostró que el test identifica correctamente el 86 % de las infecciones neurológicas. “A diferencia de otros métodos diagnósticos, el test mNGS utiliza un enfoque no dirigido que no requiere sospecha clínica previa sobre la causa de la infección. Además, permite detectar en una sola prueba todo el espectro de patógenos causantes de infecciones, como bacterias, hongos, virus y parásitos”, explicó Chiu.
Los científicos desarrollaron inicialmente una prueba clínica mNGS para analizar el líquido cefalorraquídeo, que recubre el cerebro y la médula espinal. El test se aplicó a miles de pacientes con síntomas neurológicos inexplicables, tanto en la UCSF como en otros hospitales de EE. UU. durante un ensayo de siete años de duración.
Patógenos en fluidos respiratorios
En un estudio complementario publicado en Nature Communications, el equipo también utilizó la secuenciación metagenómica de nueva generación para identificar patógenos en fluidos respiratorios que pueden causar neumonía, y lo automatizó para obtener resultados más rápidamente. Chiu comentó que “la COVID-19 aceleró el desarrollo test mNGS aplicable a infecciones respiratorias, con el fin de detectar virus antes de su propagación o para asistir en la respuesta ante una pandemia”.
Esta tecnología, agregó “es capaz de identificar virus emergentes incluso sin genomas de referencia humanos, debido a la similitud genética con virus de animales y otros organismos”. Uno de los principales desafíos fue automatizar la prueba mNGS, para que pueda realizarse en un laboratorio clínico típico. La meta era reducir el tiempo de procesamiento a menos de 24 horas y minimizar la intervención manual, lo cual simplificó el proceso de más de 100 pasos a menos de 30, explica el investigador.
Fuente: SINC
VTV/DC/DS
